התוכנה הפנימית, הרגלי חשיבה והתנהגות מתפתחים במשך כל החיים, ובו בזמן, נשארים לא מודעים. אנשים מתנהלים בהכרה מלאה, מפתחים דעות מורכבות, מתנהגים כביכול, בשיקול דעת, אבל לא מודעים, שמה שמנהל אותם, זה התוכנה הלא מודעת, שרכשו, הפנימו בגיל מוקדם, כאשר שיקול דעת שלהם עוד לא היה מפותח.
במהלך טיפול בהתכתבות, אדם מפתח תוכנות חדשות, אבל אז הוא משתמש בכל הידע והניסיון, שצבר במשך כל החיים, כולל בטיפול. הוא לא שוכח, או מאבד יכולת, להשתמש בתוכנה הישנה, אבל הוא יכול לבחור בין דרכי הפעולה האוטימויים, שהשתמש במשך שנים, ודרכי פעולה, חדשים, שהוא בחר בהם לפי הידע, ניסיון, רצון, שמתאימים למצב הנוכחי, ולא למצבים מילדותו הרחוקה.
אדם רוכש חופש בחירה. מה שנפלא פה, שאפשר לגלות כל מני אופציות, לגלגל אותם בדמיון, ולבחור את מה שנראה הכי מתאים. אדם שיש לו כמה תסריטים אלטרנטיביים, הוא הרבה יותר חופשי. אפשר לשלב, אפשר להוסיף, אפשר לשנות. הכול בצורה מודעת, עם יכולת השוואה לתוכנה המקורית, שעכשיו, גם היא מודעת.
